市区主要指城市中建造的各种特殊区域，它们提供科技、文化、生产力等核心产出。区域的选择与摆放是市区发育的第一步，每个城市都应该根据位置和发展方向来确定优先建造的区域。学院区靠近山脉能获得大量科技加成，商业中心沿河而建则能提供可观的金币收益。工业区的辐射范围可以覆盖多个城市，将其放置在几个城市的中心位置能最大化效益。圣地与自然奇观或山脉相邻，也能获得信仰加成。
区域相邻加成的利用是提升产出的核心机制，相同区域紧邻放置并不会带来额外收益，但将不同类型的区域相邻建设，例如将商业中心与港口放在一起，就能触发额外的金币加成。区域与特定地形或地貌相邻也很重要，比如学院区靠近雨林可以获得少量科技值。在初期优先建造能保障基本发展的区域更为重要，例如用于加速科技研究的学院，或是增加金币收入的商业中心。
进入中期后，工业区对于提升整体生产力变得重要，而剧院广场则是文化胜利路线。早期解锁的城市规划政策卡能够为所有城市提供区域建造速度加成，中后期则有更专业的政策卡，例如五角大楼或五轨计划，它们能针对区域提供生产力加成。区域建筑的建设与升级是后期提升产出的主要手段，在区域建成后还需要投入生产力建造其内部的各类建筑。例如学院区需要建造图书馆和大学，商业中心需要市场和银行。
这些建筑不仅能直接提升对应资源的产出，有些还为其所在城市提供住房或舒适度等额外增益。发展到现代甚至未来时代后，许多区域及其建筑还可以通过消耗金币或生产力来进行现代化升级，从而获得更强大的效果。
