独立势力是一个结合了承蒙机制和野蛮人机制的新阵营，开始游戏后，就能在地图上发现部分独立势力的部队。有些独立势力天然和玩家敌对，这些敌对的独立势力就像野蛮人一样，会自动建造部队，并在地图上到处游荡。一旦发现有任何一个定居点防备薄弱，他们就会立刻突袭这个定居点的市中心，并将此处夷为平地。而友好的独立势力只会进行自保，并不会进入到己方领土范围内。判断一个独立势力是否友好，只需要查看其部队和老巢的外围光环即可。如果这些单位或地块显示为红色，则表示他们是具有敌意的独立势力。
任何一个独立势力都能通过影响力来渗透，通过支付部分影响力让这些独立势力去攻击其他文明，也可以支付大量的外交影响力去同化一个独立势力。如果一个独立势力的态度本来就是很友好，那在标准势力下，只需要在花费影响力后等待十五个回合，它就会变为附属城邦。而如果这个城邦本来就处于敌对状态，那就需要先额外花费十五个回合来和它们建立关系，让其放弃敌对态度。然后才能再花费十五个回合，将其彻底收服。地图上的其他文明也会争先恐后的拉拢独立势力，谁先走完了对其融合的进度条，谁就能成为这个独立势力的宗主国。
当独立势力融合成功后，将不再被其他文明拉拢。因此收买独立势力将会是一场与时间的赛跑，可以在拉拢的过程中给予更多的影响力，从而加快融合进度。然而在标准速度之下，每加速一个回合就要多付出一百点的影响力，这实在是有些昂贵。因此如果一个文明已经对一个独立势力渗透了很久，那还是应该果断放弃，不要浪费来之不易的影响力。
虽然不可能把所有的独立势力全都收服，但是可以通过剿灭独立势力的形式来迫使其他文明无法融化他们。就和围剿蛮子一样，当消灭了对方的有生力量后，就能占据这个独立势力的老家，并将它彻底消灭。独立势力有四种类型，分别是科技、文化、经济和军事。如果彻底消灭其老巢，就能获得科技、文化、金钱和生产力这几种资源。在标速模式下，每消灭一个独立实力巢穴，即可获得一百点对应的资源。
