机械boss一共有三只，它们都是彼此独立并不会一起出现的，玩家在世界探索达到的一定程度之后就有可能自动刷新boss出现在地图上，玩家也可以利用手头的召唤道具对其进行召唤，三个怪物的召唤道具并不相同。在困难模式下若是玩家尚未击败BOSS，那么在击败与之对应的小怪时就有0.4%的概率掉落其召唤道具，在已经全部打完或是打怪迟迟不掉落的情况下，玩家只有自己手动利用地图特有的毡台手搓道具和晚上静候怪物刷新这两种操作。
BOSS刷新的进程要求玩家必须先打完血肉墙，让世界进入新的状态。在这里摧毁恶魔祭坛或血腥祭坛任意一个，之后即可在每晚等待10%的概率刷新出现BOSS，但这里刷新的BOSS一定是自己还未击败过的BOSS，击败过的只有利用召唤道具才可再次出现。召唤毁灭者要用机械蠕虫进行召唤，材料为暗影之魂和恶魔祭坛或血腥祭坛的基础骨肉材料和铁矿资源，召唤双子魔眼要用机械魔眼，消耗道具为晶状体和光明之魂、部分铁矿资源，最后一件机械骷髅头则用骨头和光暗双魂还有铁矿，一共四种材料制作，召唤机械骷髅王。
这三个BOSS都不是好容易对抗的存在，打完之后也会掉落有价值的道具。打法上根据怪物特性各有不同，毁灭者的特性就是利用跑图的方式来打，其作为蠕虫怪物移动速度比较慢，并且体节不会分裂，只能一起追击玩家并且永不逃跑。玩家只要在天黑时进行战斗，在路上没有其他怪物的情况下持续跑到最远处再传送回出生点，再跑图反复打伤害即可无伤通关。双子魔眼作为一对怪物比较麻烦。玩家可以先处理魔焰眼，它会进行连续冲刺，玩家只要躲开这个攻击剩下的都好打。
打激光眼时玩家可以创建一个堡垒，随便用什么东西，只要是建筑激光就无法打穿，和魔焰不同。玩家在里面还可以运用有穿透效果的武器进行输出，属于是机制杀。骷髅王比较复杂，它有多个具有单独血量的部位，但本体只有头部，所以玩家在攻击时尽量优先打头部，如果是在晚上召唤，玩家就要注意于4点半之前消灭它。否则其就会变成地牢守卫AI冲刺，碰到就会给玩家造成秒杀效果，普通状态的骷髅王还会发射激光和炮弹，但伤害不高好规避，玩家在打时自己堆满伤害，尽量爆发输出掉它就行。
