飞机不能像地面单位那样自己在地图上跑，必须驻扎在航空港、市中心或者航母里，攻击时从基地出发打射程内的目标，打完再回来。航空港区域需要先研究飞行科技才能建造，造好之后在里面盖机库和机场，飞机才有地方停。一个建全建筑的航空港可以放八架飞机，市中心只能放一架。想换基地就点转移按钮，把飞机挪到另一个有机场的城市或者航母上，转移要花整整一回合，期间飞机没法执行其他任务。航母造出来是空的，得把已经造好的飞机调上去，一艘基础航母装两架，升级之后能多装一架。
航母本身没有攻击力，躲在主力舰队后面靠飞机打输出就行。战斗机和轰炸机分工完全不同，战斗机速度快空中格斗能力强，主要任务是防空和拦截，敌方飞机进入它周围一格范围内就会被自动攻击，能有效压制对面的轰炸机和侦察机。战斗机对地面单位也有一定伤害，但攻城时战斗力会下降，拿它去拆城墙很不划算。轰炸机是攻城的主力，对城市和区域造成全额伤害，射程远升到高级之后能打九格，停在安全距离外慢慢炸城墙，城防掉到一半以下再派陆军上去占城。
两种飞机搭配使用效果最好，一般按二比一的比例配置，战斗机负责护航和清掉周围的防空单位，轰炸机专心拆城。轰炸机执行核弹投掷任务时需要保持一半以上的血量才能起飞，飞机被打伤之后回血的方式是停在机场里选择休眠，每回合会自动恢复。
