海底废墟属于一种较为稀有的海洋结构，这类海洋结构一共分为两种，分别为寒带海底废墟以及热带海底废墟。其中寒带海底废墟通常会自然生成在普通海洋以及冷水海洋里面，这里的冷水海洋与普通海洋之间的最大差别就是其颜色更深一些。当然在一些极寒区域也可以看到表面出现冰块的海洋，这些海洋底下也有可能出生成海底废墟。而寒带海底废墟的外观主要由石质的材料构成的，热带海底废墟的外观主要由砂岩构成的。这类海底废墟会生成在所有的温水类海洋中，这类海洋的表面显示为浅绿色。
其中在浅水区域可以看到大量珊瑚的海洋同样属于温水海洋，同时在温水深海的生物群系中也有可能生成热带海底废墟。这里需要注意虽然这两种海底废墟大多数都自然生成在海水中，还有也有可能出现在陆地上面。或者在任意一种海底废墟通过自然形式生成之后，一半漏出水面而另外一半仍然处于被海水淹没的状态。所有通过自然生成的海底废墟中，有百分之三十上下的海底废墟的覆盖范围属于大型的。
另外百分之七十海底废墟的有效占地面积都属于小型，在大型海底废墟周围有九十百分比的高概率，会继续生成四到八个随机数量的小型海底废墟。所有海底废墟的每一个子结构中必定会生成五个可疑的方块，并且组成海底废墟的砖块分为石砖、裂纹以及苔石砖，在小部分海底废墟中还可以观察到磨制花岗岩、海晶灯以及岩浆块等。这里需要注意在前往这两类废墟中进行地图探索之前，必须要为角色附魔上水下呼吸或者提前喝下一瓶水肺药水。
