编队操作是战术执行的核心环节。游戏采用手柄操作，编队逻辑与PC版存在差异，需通过方向键和功能键组合实现。选中单位时需按住手柄的确认键（通常为○键）并拖动选框，被框选的单位会显示生命值状态。编队上限为5组，每组最多容纳10个单位，超出部分无法被编入同一队伍。手柄操作需注意单位重叠时的精准选择，避免误选无关单位。
编队完成后，可通过L1/R1键切换不同队伍，选中队伍后按△键可快速查看该编队位置。移动指令通过方向键调整目标地点后按○键确认，攻击指令则需先按住□键再选择目标。游戏未提供PC端的移动攻击指令，需手动控制单位行进与开火节奏。编队行进时建议分散排列以避免密集阵型遭受范围伤害，按×键可临时解散编队调整站位。
电力不足会导致生产速度下降，间接影响编队补充效率。建议优先建造雷达站以扩大视野，便于编队执行侦查或突袭任务。工程师单位不可编入战斗队伍，需单独操作占领建筑或修复设施。载具与步兵混编时需注意移动速度差异，避免步兵单位脱节。
枪塔和炮塔虽不可编队，但能通过瞭望塔提供视野支援。遭遇敌方编队时，优先用L2键标记高价值目标集中火力。空袭轰炸等战略武器需提前预留选择时间，无法与常规编队操作同步执行。地形因素会显著影响编队机动性，山地和森林区域需谨慎选择行进路线。
后期战役中建议保留2-3支机动编队轮换作战。维修厂可快速恢复编队战斗力，但需防范敌方工程师偷袭。NOD阵营的隐形坦克需单独编队用于伏击，GDI阵营的悍马车队适合快速骚扰。最终关卡编队应包含至少30%的工程单位，用于即时修复关键建筑。存档功能可保存当前编队状态，但部分任务会强制重置编队配置。
手柄操作精度是影响编队效率的关键因素。建议在非战斗时段预编队伍，战时通过快捷键切换。游戏内教程未详细说明编队机制，需通过实战逐步掌握单位协同规律。PS1版本特有的输入延迟问题，需提前0.5秒输入指令以确保响应。自定义按键布局可能破坏默认编队逻辑，不建议新手修改控制方案。
