污水处理是城市规划和基础设施建设的核心环节之一。当城市规模扩大时，污水排放量会随之增加，若处理不当会导致水体污染、居民健康问题甚至城市功能瘫痪。游戏中的污水处理主要依靠排污管、污水处理厂以及地形改造等手段。排污管是最基础的设施，需要合理布局以避免污水回流或污染饮用水源。污水处理厂则是后期解锁的高效设施，能够将污水净化后再排放，显著降低环境污染。
排污管应优先布置在河流下游，避免与上游的抽水站重叠。若将排污管错误放置在上游，抽水站可能会抽取到被污染的水源，导致全城供水系统瘫痪。需要暂停游戏，调整排污管位置至下游，并确保其覆盖所有污水产生区域。排污管需要与城市供水管网完全分离，避免交叉污染。若预算有限，初期可采用低成本排污方案，待人口增长后再升级为污水处理厂。
污水处理厂是更高效的解决方案，能够将污水净化后排放或循环利用。该设施需要一定的人口规模和技术解锁，建造后需连接至城市排污系统。污水处理厂的净化效率较高，适合中大型城市使用。若城市临近海洋，也可考虑将污水直接排入深海，但需注意洋流方向，避免污染回流。工业区的污水排放量较大，建议单独设置排污管道，避免与居民区混合。
地形改造是应对污水倒灌的有效方法。若污水因水位问题倒灌至城市，可通过暂停游戏，挖低河床或抬高周边地形形成隔离带。另一种方法是利用抽水器将污水引入人工挖掘的深坑，再通过反复填埋和挖掘将污水彻底清除。此方法操作复杂但效果显著，适合突发性污染事件。需地形改造成本较高，需谨慎评估预算。
工业区应远离居民区和饮用水源，避免交叉污染。污水处理设施需预留升级空间，以适应城市发展需求。定期检查排污系统运行状态，及时修复或升级老化设施，可有效预防大规模污染事件。游戏中的污染治理是一个动态过程，需要根据城市发展阶段调整策略。
