孤岛主线的通关流程最终目标就是击败三位守护者BOSS，并在火山深处的泰克洞穴中战胜最终首领监察者完成飞升。开局第一步是在南部海岸这类相对安全的区域建立第一个落脚点，首要任务是制作石镐、石斧和长矛这三件套，通过采集和狩猎来维持生存并提升等级。印痕技能点要优先学习流星锤、弓和麻醉箭，它们是驯服第一只实用恐龙的基础。早期驯服一头副栉龙能帮忙高效采集浆果，而三角龙则是战斗和采集的好帮手。达到十六级后，建造木筏前往东南角的素食岛会是个不错的选择，那里没有肉食恐龙，是安全驯养大型生物的绝佳地点。
当进入铁器时代，制作出熔炉和铁匠台后，发展重心就要转向获取金属资源和更高级的恐龙。驯服一只甲龙能极大提升金属采集效率，同时务必驯服一只无齿翼龙，飞行能力对探索地图和运输资源至关重要。此时可以考虑将基地搬迁到资源更丰富的区域，例如西部平原。到了五十一级解锁低温仓后，就可以高效地携带战斗龙群进入矿洞探索了。要挑战BOSS，必须先收集神器。孤岛地图上分布着十个洞穴，里面藏着关键的上古神器。洞穴探险危险重重，建议优先驯服重爪龙、袋狮等生物来应对复杂地形。
推荐的探索顺序是先易后难，例如从南二矿洞猎手神器和熔岩矿洞稳重神器开始。每个洞穴的环境都不同，有的充满毒气有的布满岩浆，需要针对性准备潜水套装、血包和火把等装备。集齐神器后就可以前往三个方尖碑分别挑战三位守护者BOSS了，育母蜘蛛推荐使用对昆虫有克制效果的大地懒作为主力，配合高攻击的恐爪龙进行输出。大金刚可以骑着羽暴龙提供群体增益，指挥一群镰刀龙或恐爪龙进行攻击，但要小心躲避它投掷的巨石。
喷火龙开局需要优先清理它召唤的翼龙，等它落地后，再指挥恐龙集中攻击其弱点部位。每击败一位BOSS，都能获得重要的泰克科技蓝图。击败三位守护者后，就获得了进入火山泰克洞穴挑战最终首领监察者的资格。与监察者的战斗异常艰难，它会放电并将人从坐骑上击落，还会召唤大量机械单位。推荐带上高血量的霸王龙或镰刀龙作为主力，由羽暴龙提供增益，凶齿豨进行治疗。成功击败监察者并完成飞升仪式，就真正通关了孤岛的主线。
