特殊事件主要分为在夜晚睡梦中发生的随机事件和随着剧情推进而触发的固定事件，这些事件有的能带来丰厚的资源，有的则会开启全新的区域或功能，了解它们的作用能更好地应对农场里的各种变化。每天夜晚入睡后，都有几率触发一个随机事件，这些事件效果也各不相同。这其中有不少是能带来实惠的好事，比如农作物仙子事件就有约百分之一的概率在非冬天的晴夜出现，她会施展魔法让农场里一片5x5区域的作物瞬间成熟，可以立刻收获。
要是农场里有成熟的玫瑰仙子，这个事件的触发概率还能提升。女巫事件也很有意思，同样是百分之一的触发概率。如果她飞过升级过的鸡舍，第二天早上就会留下一枚虚空蛋，孵化后能得到一只虚空鸡，下的蛋可以卖出更高价格。在达成百分百进度后，女巫甚至可能留下一枚金蛋。不过如果女巫飞过的是史莱姆屋，就会把里面的史莱姆都变成更具攻击性的黑色史莱姆，但如果在屋里放一个邪恶雕像就能避免这种情况。
有些事件则需要付出一点劳动才能换来回报，同样是百分之一概率的陨石事件，会在农场留下一块巨大的陨石，需要金镐或更高级的镐子才能敲碎。不过回报也很丰厚，不仅能获得铱矿石和晶球，还有四分之一的几率得到一个珍贵的五彩碎片。在解锁温室后，每个夜晚都有百分之十的概率触发大风事件，它会在煤矿森林吹倒一棵大树留下树桩，与之互动就能开启一个任务，这是通往新区域姜岛的重要一步。
除了这些还有一些纯粹增加趣味性的事件，奇怪的胶囊事件在第一年后有极低的概率触发，会得到一个奇怪的胶囊，放在地上几天后会破损变成空置胶囊。石猫头鹰事件的发生概率则只有百分之零点五，会在农场留下一尊石猫头鹰雕像作为装饰。除了夜晚的随机事件，还有一些重要的固定事件。第一年夏季的第三天会固定发生地震，从而解锁铁路区域。另一个重要的事件是设施维修，每当完成社区中心的一个收集包，或者完成Joja社区发展申请书的一个项目时，都会触发一个过场动画，展示相应设施被修复，并解锁新的功能或区域。
