洞穴的新地区远古墓穴很有意思，要到达那里，得先去地表深海新刷的一个大漩涡。大漩涡会持续吸入物品、摧毁结构、删除生物，只有飞鸟可以逃脱它的吸力。玩家和物品被吸入后，就会被送到远古墓穴的大厅部分。在这里可以跳进陷洞，落到远古档案馆的传送门旁边。当然没法从传送门返回远古墓穴，如果想再进入远古墓穴，还得再走一遍大漩涡。如果档案馆的发电机处于激活状态，那么远古墓穴中的这些传送装置就可以被使用。
使用墓穴大厅传送装置，就能到达远古墓穴的迷宫部分。这里的迷宫房间和哈姆雷特的房间有点像，需要使用房间角落的传送装置，才能到达其他房间。并且这些房间组成的是一个非欧几何迷宫，走起来非常头晕，还好每个世界迷宫房间的数量和连接关系都是一样的。在每个房间中，门的位置是可以随机的。比如说枢纽房中四扇门必定连接面具房和通道房一二三，但在没有走过之前，无法判断哪一扇门连接的是哪一个房间。在远古墓穴中有很多带有背景剧情的石碑，大部分角色都看不懂上面的文字，检查后也只会说这些文字我看不懂。此时需要带上在面具房中获得的三个面具，就可以读懂其中的文字。
而想到达迷宫的深层部分，必须通过解谜房能解迷，拉下拉杆就会开始解谜小游戏。此时虚空区域会出现能踩一次的石堆，跳上去后，还会出现两个人偶跟着玩家踩石堆。人偶的行动实际上是在复制玩家的行动，如果往前跳一格，人偶也会向各自面前的方向跳一格。向左跳一格，那么人偶也会向左转向再跳一格。人偶很容易就能把玩家通路石堆给踩踏，最终玩家会因为在单个石堆上站立太久而压垮石堆回到起点。虽然这个小游戏很难，还有时间限制。不过它实际上只有三种固定的模板，只需上下背板就可以轻松通过这个解谜。
深层迷宫中有一些破碎的传送装置，把它们拼好就可以打开通往浅层迷宫的捷径。如果在没有打开捷印前，就在浅层迷宫试图前往深层迷宫，那就只能得到这扇门只能从另一侧打开的结果。在深层迷宫中还有一个全是远古士兵雕像的房间，这个房间有一扇无法打开的门，是通往下一阶段的地区。
