被占领的城市和自己所建造的城市基本没有什么太大区别，当攻克了一座城市后，这座城市就可以开始为自己服务。我方的帝国可以百分百的获取该城市的一切收益，比如产出的奢侈品和文化点等。被占领的城市因为处于军事管制之下，所以即便没有点开任何用来镇压叛乱的军事政策，这座城市也会因为市中心驻扎了军事单位而享受五点忠诚度。所以当一座城市被攻占后，它的绝大多数功能均是可以正常运转的，不过该城市此时和被实际所拥有还是有一些细微区别的。
即便该城市的生命值是满的，只要该城市仍旧处于被占领的状态，就不能作为一个商品和其他国家进行交易。此时就需要先去和这座城市的原本的建立者和谈，并要求他割让这座城市，才可以彻底的使用这座城市。而割让城市作为一个外交条件，是可以成为电脑玩家讨价还价的筹码的。许多电脑玩家会根据目前的军事实力以及国际关系等因素来考虑是否要正式将这座城市割让，并换取和平。如果电脑觉得玩家很强大，那它们不仅会割地，而且还会赔款。如果电脑觉得玩家和它的实力差不多，可能会要求玩家给它赔款，然后才会同意割让土地。
极个别拥有特殊议程的首领，像是亚历山大和戈尔戈，就属于绝对不会同时割地赔款的领袖。如果占领了这些领袖的土地，需要给一笔赔偿金换取土地。或者把打下来的土地还给他们，让他们赔一笔钱。如果两个条件都不愿意接受，那就会和玩家死磕到底，直到被彻底消灭。虽然其他领袖不像是这两个领袖那么耿直，但也说明了一个问题。那就是在占据了一座城市后，如果想立刻和电脑和平，就需要征得对方的同意。如果对方不同意，那这场战争就会一直进行下去。
所有通过军事手段夺取的城市，都会出现一个被侵略国家的不满因素，被侵略国家对玩家的不满度越高。那这座城市就会越不忠诚，这个不满度会一直存在着，就算战争结束了，该不满度还是会存在。直到其原主人的气彻底消了，或者是彻底断气了，不满度才会消失。而且当一座城市被割让后，该城市就不再处于被占领状态了，因此驻军的五点忠诚度加就会自动消失。
