仓库也可以理解为游戏里的背包，仓库并没有具体的地点，在飞船按ESC点击配备物品，就可以看到仓库内的所有物品。仓库内的物品非常多，所以一般会使用搜索栏选项卡来寻找物品。搜索栏在右上角，不仅可以搜索物品名称，还可以通过搜索物品的描述来寻找物品。比如搜索悟空，不仅可以搜索到悟空的相关部件，还可以搜索到悟空P的核桃，非常方便。上方的选项卡将物品分为战甲、武器等各种类型。为了方便分类寻找，搜索和选项卡中间还有个排序，可以将物品按名称、售价、拥有数量来排序。搜索、排序、选项卡分类结合使用，能帮助玩家快速找到自己想要的物品。
游戏里的大多数界面都有搜索、排序和选项卡功能，比如MOD界面、铸造厂界面、NPC商店界面等。在仓库可以售卖物品，可售卖的物品会显示它的价格，不可售卖的物品则会有不可售卖的描述。选择一件可售卖的物品，右边就是待出售的物品，点击右下角的出售即可卖成现金。卖之前一定要检查待出售的物品，以防卖错物品。急缺现金时，可以选择排序方式为售价，把价格高而且数量多的物品能卖掉一些。比如主教机体，点击鼠标滚轮键，可以一键选择全部物品，不用再输入数量。
不过仓库空间是没有上限的，物品可以无限收集。所以不用担心仓库装不下的问题，这也刚好符合了仓鼠的本质。但是可装备的物品是有槽位限制的，在战甲、武器、同伴载具、空战武器、殁世机甲、增幅器这些选项卡中，可以看到有槽位这一栏。而槽位左上角有勾的符号，就代表有空余，槽位后面的数字是剩余的空余舱位。槽位左上角显示是白金符号的，代表没有剩余仓位，需要用白金购买槽位。
如果在槽位不够时，玩家可以将用不着的装备卖掉，空出槽位。非常不推荐卖战甲，因为后期可以将不用的普通战甲喂大嘴。但是MK1系列武器是可以随便卖的，因为在商店可以用现金直接购买成品武器。像蛇发女妖、野猪这种容易获取的武器，水完经验就可以考虑卖掉。而像破碎战争之剑这种任务给的武器，因为获取难度较高，而且还可以用它合成战争之剑，所以最好就不要卖。
