在文明落后于其他文明时，间谍是个非常有效的追赶机制。而且也可以玩某些特定文明，强化间谍的效果，玩出新的花样和套路。在把外交部解锁后，就能造间谍了。间谍也有容量限制，不过可以通过解锁新的市政，根据文明特性或者利用市政广场的建筑来获得额外的间谍容量。可获得间谍的市政包括外交部门、民族主义意识形态、冷战，而且科技树的电脑以及情报局也能使获得额外的间谍容量。还有结社模式弥涅尔瓦夜鹰的教化也能增加间谍容量。
常规模式下不算文明特性，一个文明随着游戏的发展至多可获得六名间谍。间谍被归类为平民单位，故间谍的建造成本会和开拓者以及建造者一样。随着生产的间谍越来越多，其所需的生产力成本就会越来越高。即每造一名间谍，下一名间谍的生产力需求会提升七十五点。生产间谍不需要额外的建筑或区域要求，一旦解锁，任何一座城市都是可以生产间谍的。不过由于其高昂的造价，且无法通过金币和信仰值购买。更多的时候会给到生产力富裕的城市来生产间谍，或者直接在老马的城市砍出来。
当间谍从一座城市生产出来后，其移动的方式并不像其他单位那样通过鼠标指定目的地在地块中移动。而是以城市为单位点对点的移动，就像伟人在城市中切换那样。不过不一样的是，伟人的切换是当下回合瞬移，而间谍想要切换城市则需要回合周期。间谍切换城市时消耗的回合数总共有两部分组成，移动力和回合数。当点击间谍的时候，鼠标移到左侧浮窗右上方数字，可以看到这两部分需要相应的回合数。对于间谍切换城市所需的移动力回合数来说，不论两座城市距离多远，基础都是四回合。
不过移动力回合数并不是一个定值数，当一座城市的交通足够便利时会减少间谍所需的移动力回合数。当目标城市拥有商业中心时，移动力回合数减一回合。当目标城市拥有港口时，移动力回合数减二回合。目标城市拥有航空港时，移动力回合数减三回合。移动力回合数互不叠加取高值，比如一座城市既拥有港口又拥有商业中心，其所需的移动力回合数为减二回合。
