前往五之岛的关键前提是完成一周目剧情并击败四天王，之后需从枯叶市码头乘船。在枯叶市码头与水手对话后，选择乘坐圣安奴号游轮，该船只可依次抵达一之岛至七之岛。若未触发乘船剧情，需确保已在大木研究所升级全国图鉴，且至少捕捉60种宝可梦。
登船后首次航行会直接到达一之岛，需在此完成红宝石任务。与岛屿PC中心内的研究员对话后，前往灯火山击败火箭队成员获取密码线索，随后进入山顶洞穴取得红宝石。将红宝石交给研究员可解锁彩虹通行证，此后可自由选择前往其他岛屿。返回码头与水手对话，选择五之岛作为目的地即可启程。
五之岛的主要区域包括火箭队仓库、不归洞穴及高级度假村。火箭队仓库需输入两组密码：第一组多多少少、少少多多需从灯火山的火箭队成员处获取；第二组大大小小、小小大大需在六之岛的点之穴击败研究员澄夫后获得。输入正确密码后进入仓库，击败内部的火箭队首领即可推进剧情。
不归洞穴是五之岛的迷宫区域，需按特定路径行进：右→下→右→上→下→上→右→上→下→下→右→右→右→上→下→下→右→左→下→右→上。洞穴深处可获取奇异甜食，完成后返回高级度假村与NPC秋穗对话，展示其指定的宝可梦可获得随机道具。
完成五之岛任务后，建议前往六之岛获取蓝宝石以解锁后续通讯功能。五之岛与主线剧情紧密关联，需注意携带具备冲浪、怪力等秘传技能的宝可梦以应对地形障碍。若中途卡关，可反复检查密码获取流程或回溯岛屿间的任务触发条件。
