想要弄到第三代红绿宝石的御三家需要去推进主线剧情直到二周目，在城都地区的一周目主线剧情里，玩家是没有任何机会可以弄到第三代的御三家的。玩家需要跟着主线剧情去通关城都地区的全部道馆，再穿过冠军之路前往石英高原的宝可梦联盟击败四大天王和最终的冠军阿渡。等到屏幕上播完制作人员的名单后玩家会重新在自己的家中醒来，这时候玩家就可以去找第三代的御三家了。
玩家需要前往若叶镇的博士研究所获取船票并坐船前往关都地区，到了关都地区后玩家还需要继续打通关都地区的全部道馆，把两个地区的十六个徽章给全部拿到手。拿完全部的道馆徽章后玩家需要去挑战白银山最深处的初代主角赤红，用自己的宝可梦队伍把赤红的所有的宝可梦给打败后，玩家会再看一遍制作人员名单。
在白银山击败赤红后玩家就需要前往金黄市，在金黄市的中心有一栋非常高的大楼，这就是曾经被火箭队占领过的西尔佛公司总部。玩家需要进入这栋大楼的一楼大厅，一进门就能看到大厅里站着一位NPC，这位NPC就是丰缘地区的冠军大吾。这时候大吾会主动找玩家对话，在与大吾对完话后，大吾会让玩家从三个颜色石头里挑选一个作为礼物，这三个颜色的石头代表的就是三代御三家，玩家选哪种颜色大吾就会送给玩家对应颜色的御三家宝可梦。
