想要拿到潜水这个技能就必须完成一周目的全部主线剧情，需要一路先后打败八个道馆的馆主，成功挑战四天王，并最终在N的城堡里解决掉等离子队的危机。之后会重新加载存档回到位于鹿子镇的家中，被妈妈亲切地问候走下楼梯，合众地区的二周目就会正式开启。此时直接推门而出会发现国际刑警正等在门外，他会交给玩家一个寻找等离子队七贤者的后续任务。
接到任务拿到全国图鉴了后使用飞翔或者步行前往涟漪镇，这个小镇位于地图的右侧海岸边。进入涟漪镇后会发现这里有很多别致的别墅，前往位于镇子左侧的一栋民宅，推门进去会看到一个NPC。这个角色就是神奥地区的冠军希罗娜，在希罗娜附近还有一名男NPC，走过去和他对话，他会向玩家描述关于涟漪湾海底遗迹的传说，并在对话结束时直接将秘传学习器潜水交给玩家。
在合众地区潜水的使用限制非常严格，它几乎是专门为了海底遗迹这个特殊场景设计的。需要带上一只能够学会潜水的宝可梦，将技能学习完毕后来到涟漪镇东边的涟漪湾。在海面上冲浪时会注意到水面上分布着四块颜色明显比周围深很多的圆形区域，这些就是潜水下潜点。操控角色划船或冲浪到这些深色区域的正上方时，按A键系统就会提示是否要使用潜水，确认之后就会骑着宝可梦潜入深海，进入传说中的海底遗迹。
