舰艇之间的配合是要根据玩家在不同阶段的发展来具体搭配，最基本的需要有输出、辅助和抗伤这几个板块。在开荒时期，最基础的输出舰船就够用了，可以带两个抗伤用的舰船和一个用作奶的舰船，三个的输出位置可以在开荒时期打过大部分的，也不要着急升级和更换，等到战斗有压力的时候再进行更换。可以省下很多的培养资源，也能一步到位的将下一阶段的舰艇培养完毕。
抗伤的舰船可以用fg30000装甲型，输出用斗牛级，后面的火力支援用刺水母型号，这个搭配是在前期造价很低的配置，对于大部分的玩家来说很容易成型，也就是依靠这个搭配来积累接下来的发展资源。在中期的时候也就是大本营在6级左右需要换阵容了，斗牛和刺水母依然可以用，主力的舰船换成光锥突击型、雷里亚特鱼雷型这类输出更高的舰船。更换阵容之后不管是血量还是防御都会提高很多，输出方式更加的全面，还有了基本的防空能力。
在后期中当大本营达到了9级可以换成更加高级的阵容，前排使用st59战巡舰船，中间的输出改成新君士坦丁大帝级，外加枪骑兵来打造防空，这个阵容在后期中也能算的上是豪华了，不过是需要航母的，整体的强度高但打造的资源也够多。前排的舰船优先将护甲高和闪避高的排到前面，中排就用爆发和输出最高的舰船，后排可以派一些有对空能力的。
