相比于前作《深空梦里人2》全新升级的生存系统，更具层次感的船员任务，以及更加让人紧张的投掷机制，都让它更具魅力。《深空梦里人2》的RPG元素更接近于《Blade in the Dark》和《Ironsword》这样的桌游，而非《龙与地下城》或《最终幻想》等更主流的RPG游戏。这一点最直观的体现在规划和准备阶段，玩家与角色属性的互动极为有限，能力强弱会影响所做的一切，而如何合理分配有限的投资来完成任务才是核心决策。但除此之外几乎没有办法调整投掷结果，也难以建立缓冲来抵御可能产生的后果。
《深空梦里人2》始终坚持这样一个理念，当无法通过最优解来推平逆境时，才能感受到真正的戏剧性，它改善了前作过于被动的体验，会迫使玩家在每次抉择时仔细斟酌每一个选项。主角沉睡者是一名拥有机械躯体的仿生人，玩家可以在三种职业里进行选择。例如采矿工擅长承受高强度的体力劳动，并且在面对高风险环境时表现出色，但在精细操作和技术性工作方面极为吃力。
相比前作每个职业的优缺点在本作中都有所调整，其目的是加强投资系统的紧张刺激性，角色的弱项属性是完全无法提升的。如果使用这一属性进行相关行动，像采矿工使用直觉技能就会被额外扣除两个点数。尽管大多数行动都会给出两种不同的属性检定选择，但如果遇到必须使用弱项属性才能过关的情况，这种减值惩罚会大大降低成功的几率。
《深空梦里人2》改进了船员系统，同伴能在更复杂的任务发挥作用，推荐带上最多两名船员执行特殊任务。比如拆解太空中的废弃飞船或勘测小行星，来寻找可饮用水源等等，每位船员都有自己的专长并且拥有一对骰子。玩家可以自由分配他们的骰子去完成任务，那些需要更多人手的任务通常更耗时，需要经历多个阶段持续多个循环才能完成。
每颗骰子最多可承受三点伤害，一旦损坏便无法继续使用除非进行修复，而修复过后的骰子再次投入使用，需要消耗一种不算稀缺但无法随时随地获取的资源。本作中几乎每个任务都与建立联系和培养人际关系挂钩，构建社区是前作故事的核心主题，而二代在其跨越多个星系的旅程中，通过剧情和玩法再次强化了这一要素。
