巨石枝树苗的主要刷出点位为远古洞穴内的喷气孔群系，使用基础工具中的斧头就可以将其砍掉并掉落树枝、木头以及木炭，拾取到这些燃料就可以稳定度过低温环境。如果操控手持斧头的角色对巨石形态下的树苗进行砍伐的话，就会在连续砍伐之后进入到树苗形态。进入到树苗形态后在后续的五天之内会停止往下一阶段生长，只有长时间处于潮湿状态才会回到自然生长周期内。
并且巨石枝树苗还属于一种可进行移植的再生型资源作物，所以空手就可以把未成熟的巨石枝树苗采摘走，把采摘到的树苗播种在其他地块同样会继续生长到大树阶段。通过这种形式种下去的巨石枝树苗即使一直不施加肥料，也会自动从最初的树苗阶段生长到大树形态。使用斧头将巨石枝砍伐后出现的掉落物还可以直接当做柴火使用，尤其是在低温的冬季环境需要在屋子内依靠火堆来维持角色体温正常时，就需要消耗掉大量的燃料使火堆持续处于燃烧状态。在火焰完全熄灭掉之前手持蜘蛛网树苗并朝着火坑中心丢一下，这样被丢到火坑内的蜘蛛网树苗就会当做维持火焰燃烧时长的燃料消耗掉。
只需要将一株挖到的巨石枝树苗丢入到火坑里面，此处的火堆就会在多燃烧一百八十秒后自动熄灭掉。这里也可以将任意品质的斧头装备在角色身上，随后手持斧头并对着地图中的巨石枝树苗按一下使用键，这样就可以操控角色挥动斧头将巨石枝树苗给砍断掉。这里需要注意虽然巨石枝树苗有高概率会生成在喷气孔群系内，但是在主世界中的这种地形进入到火山季之后，几乎所有的树苗有很大概率在成长大树之前全部枯萎掉。由于这些树苗都是经受不住高温而直接枯萎掉的，所以在火山季持续期间维持植株一直活性状态，就需要借助其他的降温工具来防止树苗长时间处于高温状态下。
当喷气孔群系在结束秋季进入到冬季时，由于低温环境的影响同样会对所有的作物树苗产出较大程度的生长影响，此时就可以选择用斧头把已经停止生长的树苗给砍掉。砍掉百分百会出现普通树枝这类掉落物，所以一定不能选在冬季去挖喷气孔群系中生长出的树苗。当然在联机版本中还有可能在原木墓穴内找到刷出的巨石枝树苗，相对于其他生成区域来说，这里刷出的巨石枝树苗只适合加工成生火燃料使用。在控制角色砍伐巨石枝树苗时还有可能将树精守卫给引出来，所以这种树苗的最后一种用途就是重复刷树精守卫的掉落物。树精守卫的最大生命值只有五百点，所以使用中等攻击属性的武器就可以将其速杀掉。每杀掉一只树精守卫可能出现的掉落物有三种，分别为噩梦燃料、怪物肉以及活木。
