秘鲁丛林是遇到的第一个大型开放区域，沿着丛林小路往前走会碰到飞机残骸营地。营地旁边可以捡到两件文物，一个是帐篷里的飞行日志，另一个是营地右侧小道尽头墙上的手帕。在营地可以解锁技能树，用之前积累的经验点数学习新技能。离开营地后来到一处水潭，劳拉的装备挂在树上够不着，需要一把刀来割断绳索。走到水潭左侧的飞机残骸前端，触发剧情螺旋桨会滑入水中。跳进水里从螺旋桨上掰下一块金属片，期间会有条鳗鱼来攻击，快速按键把它解决掉。
回到岸上发现刀刃太钝割不断绳子，需要找三个残料木箱来打磨它。木箱散落在水潭周围，收集齐之后回到营地打开制作界面，就能把金属片做成临时匕首。拿到匕首后回到水潭边割断第一根绳索，然后爬上左边的岩石结构或者有抓痕的树，割断第二根绳索。装备包掉到地上，从中取回劳拉的弓和无线电。拿到弓之后就可以在周围自由探索了，这个区域有不少资源和收集品可以搜刮。水潭右侧有一棵带抓痕的树可以爬上去，跳到对面带白色标记的岩壁上能拿到文物六分仪。拿到弓箭后需要制作一些箭矢，从树上折下树枝，从鸟巢里收集羽毛。
路上还能找到紫茉莉植物，可以采集用于制作专注药剂。继续沿着山路前进，途中需要用弓箭射击绳索连接的锚点来搭建通路。往前走会遇到一个需要与约拿配合的桥梁谜题，爬到左侧塔顶启动水闸合作推动底部机关把水引到容器。容器破损后需要射击绳圈来固定桥梁，过了桥之后继续深入丛林，路上会遇到一些敌人。优先利用草丛和树木进行潜行暗杀，遇到高处的弓箭手优先解决。秘鲁丛林区域有两个挑战古墓值得探索，审判凝视古墓入口藏在瀑布后方，需要用攀爬斧清除藤蔓障碍才能进入。
内部以绳索摆荡和岩壁攀爬为主，利用求生本能高亮抓点可以避免坠落。冥界之门古墓位于峡谷废墟营地旁边，需要拉动转盘机关顺时针旋转，然后射出绳索箭矢在缺口上方搭建通道，完成这两个古墓挑战可以获得技能点数和装备。如果想达成区域100%完成度，秘鲁丛林总共需要收集34项物品，包括文物、壁画和求生贮藏点，其中遗物六分仪和福西特的最后信件位于隐蔽洞穴内。
