果树是稳定获取水果的重要来源，获取果树的第一步是购买树苗，皮埃尔的杂货店提供多种基础果树苗。包括春季结果的樱桃树苗和杏树苗，夏季结果的橘树苗和桃树苗，以及秋季结果的苹果树苗和石榴树苗。这些树苗价格从2000g到6000g不等，除了在皮埃尔商店购买，姜岛提供了获取特殊果树的机会。在姜岛商人处，可以用5个龙牙兑换香蕉树苗，或者用75个蚌交换芒果幼苗。金色椰子也有几率开出这两种树苗，完成岛屿办事处的巨大动物化石收集后，还能从蜗牛教授那里领取一个香蕉树苗。
沙漠节期间雷欧的商铺会以100个卡利科三花蛋的价格出售一个香蕉树苗，种下树苗需要确保周围3x3的地块完全空置，不能有任何障碍物。树苗生长期间，每棵树的3x3范围内不能有任何物体、地板甚至草地，这个区域也不能与其他果树的种植区域重叠。等到28天成熟后，果树就会在相应季节每天结出一个水果。将果树种在温室或姜岛上，则可以全年结果。
果树成熟后水果品质会逐年提升，第一年是普通品质，第二年银星第三年金星，第四年就能产出铱星品质的水果。树上最多能同时挂三个水果要及时采摘，遇到雷雨天气，果树被闪电击中后会连续四天只产出煤炭。砍倒果树会获得木材，有几率掉落对应树苗。如果砍伐的是成熟果树，掉落树苗的品质会与果树产出的水果品质相同，高品质树苗生长速度更快。
