肥料在种植过程中起到关键作用，影响作物生长速度和品质。初期获得肥料的方式相对简单，通过收集树液就能制作初级肥料，配方是两份树液合成一份肥料，树液可以从砍伐树木后的残留物中获得，或者直接花费100金币在皮埃尔商店购买。这种肥料需要在播种前撒入土地，能够提升作物初次收获时出现高品质产品的概率，但每块地只能生效一次。随着耕种技能提升到3级，可以解锁生长激素的配方，制作需要两份树液和一条任意品种的鱼。
生长激素能缩短作物生长周期，适合用于高价值或需要快速收获的作物。中期阶段还能通过提升觅食等级获得其他类型肥料，例如树肥需要觅食7级解锁，配方为五份纤维和五份石头，专门用于加速野生树木生长。高级肥料则需要耕种等级达到9级才能解锁，制作材料包括树液和鱼类。游戏后期在齐先生核桃房花费20齐钻兑换顶级肥料图纸，使用后提升高品质作物的产出。
姜岛商人处还能用50火山晶石兑换顶级保湿土壤，确保土地隔夜保持湿润，减少重复浇水的麻烦。施肥时要注意时机，所有肥料必须在播种前使用，一旦种子种下就无法追加。灌溉系统与肥料配合使用效果更好，初期升级水壶容量能提高单次浇水效率，解锁洒水器后可以自动覆盖周围地块，节省下来的时间能用于其他农活。日常照料动物时收集的草料也能作为肥料原料，用镰刀收割牧草后储存进谷仓，既能喂养牲畜又可参与合成。
