玩家在打通了一周目的四天王和冠军竹兰后，要把神奥地区的本地宝可梦全都见一遍，只要玩家在冒险途中和各个训练家的宝可梦对战过，或者在野外遇到过就可以，不需要捕捉。见过全部的神奥地区宝可梦后，玩家就可以去找到博士将自己的图鉴升级为全国图鉴，这个时候玩家需要前往神奥地区第七个道馆所在的雪峰市。
从雪峰市的下方乘船可以前往二周目的对战开拓区，来到这里后玩家需要一路往右上方走，穿过二百二十五号道路和二百二十六号水路，来到一个叫做生存区的小镇。在生存区里面，玩家可以找到麦可的房子，进入房子与里面的NPC进行对话后离开。这个时候玩家需要使用飞翔飞回到百代市，百代市的左下角有一间研究所，那就是大木博士在神奥地区的所在地。
玩家走进研究所后，需要直接走到最里面和大木博士进行对话，大木博士会提到关东地区的急冻鸟、闪电鸟和火焰鸟现在已经飞到了神奥地区。这段对话结束后，关东地区的急冻鸟、闪电鸟和火焰鸟这三只三圣鸟就会变成全图随机游走的状态。玩家必须打开自己的宝可梦手表切换到地图追踪功能，在这个功能界面上，玩家可以看到火焰鸟的图标。火焰鸟也会随着玩家切换场景而跟着随机刷新位置，玩家可以站在城市与野外道路的交界处，反复在城市和道路之间来回走动。每当玩家切换一次场景，火焰鸟就会随机刷新一次位置，等到火焰鸟刷新到自己所在区域时，玩家就可以跑去草丛里遇见并抓住火焰鸟了。
