漩涡鸣人自来也属于双人战斗忍者，在进入到忍者界面以及备战页面后，就可以对这两个旋涡鸣人以及自来也的出场顺序进行随意调整。当其中任意一个角色处于静止、移动或者普攻状态时，都可以通过点按奥义键将一个后台忍者切到主控位。虽然漩涡鸣人与自来也采用共享一段血条的机制，但是实战中这两个忍者各自的普攻以及技能模组都是独立的，技能冷却以及奥义点消耗都是共用的。如果在当前这一段普攻打完之前就切人的话，则位于场地内的登场角色会优先将普攻打完再退场。
当其中有一个角色与本回合内被对手反杀掉的话，之后的所有回合都无法将已经处于阵亡状态的忍者切到前台主控位。同时在各自的血条下方都可以观察到两段蓝色查克拉能量条，使用任意角色的主动技就会出现一段查克拉能量条消耗。其中鸣人的四段独立普攻模组中，三段普攻的分身上踢以及四段普攻的背包下砸，都可以将打中的受击目标踢飞以及砸飞。鸣人的一技能为色诱之术，点按一技能图标后本体就会变身并对周围敌人进行魅惑，被魅惑的敌人在一小段时间内无法动弹。
紧接着就是鸣人的二技能多重影分身之术，释放后本体会原地结印并将四个影分身同时召唤出来。随后所有影分身会同时起跳并对敌人用出数段冲拳连击，这里需要注意在四个影分身全部出现在场内后，如果无缝点按一技能键的话则四个分身连带本体，会同时变身并使魅惑范围将全屏覆盖。在操控鸣人打出普攻或者释放主动技时点按奥义键的话，可以立刻将自来也切到主控位并释放对应的切换技。此时自来也本体就会骑着蛤蟆会对手头顶落下，然后将下方的受击敌人给砸飞。自来也的四段普攻中三段甩头发能够稳定将对手扫飞，其第一个主动技为针地藏忍法。释放后本体会向前突进并将自身完全包裹住之后，施展尖刺将近距离的敌人给扎飞。
针地藏忍法属于霸体技，并且在霸体生效期间自来也火获取到高伤害见面增益。接下来就是自来也的二技能通灵术，使用后本体会骑在蛤蟆中背上吐舌将对方缠绕住并甩飞。而漩涡鸣人自来也可以释放出两种不同形式的奥义，首先就是两个忍者之间的连携奥义使徒螺旋丸，在发动切换技之后长按奥义键会立刻出现四颗奥义点消耗。随后自来也与身旁的鸣人同时将螺旋丸凝聚出来，然后共同将螺旋丸推出并将对手夹在中间终结掉。除开连携奥义旋涡鸣人以及自来也也可以选择释放自身的专属奥义，不管是使用专属奥义还是连携奥义都会出现四颗奥义点消耗。当漩涡鸣人与自来也中有一人处于脱战状态时，则另外一名仍然存活着的忍者就会被激怒到强化形态。
