想要抓住由克希这只象征着知识的传说宝可梦，玩家需要打败联盟冠军入驻名人堂，这样才能开启游戏二周目的剧情。在打败联盟冠军后玩家需要前往合众地区的二十号道路，那里藏着一个叫做心之空洞的神秘洞穴。从立涌市往右边走就能进入二十号道路，玩家需要带上一只学会了秘传技冲浪和攀瀑的宝可梦，顺着水流一直往南划，直到看见一处瀑布。
顺着瀑布爬上去后，玩家会发现一个不起眼的小山洞，这就是触发三圣菇剧情的重要地点。玩家一进入洞穴就会遇到红豆杉博士，随后由克希、艾姆利多和亚克诺姆就会在玩家面前出现，接着它们会分别飞往合众地区的三个不同地区，而玩家要找的目标由克希就飞向了游戏初期的城市七宝市。
到达七宝市后玩家不要在路边瞎转悠，而是要直接奔向城市最北边的那个大建筑，也就是以前的七宝道馆兼现在的七宝博物馆。由克希并不会直接飘在博物馆门口等玩家，它目前是处于隐身状态。玩家需要走到博物馆正门口那片半圆形的台阶区域仔细观察地面，触发位置大概是在博物馆大门口外面的那一圈石板路的正中心，也就是正对着博物馆大门稍稍靠后一点的位置。当玩家走到这个特定的格子上时，屏幕画面会弹出一个对话框，只要玩家按下了确定键，由克希就会现出原形直接出现在玩家面前并进入对战。
