忍界联军是联合行动的团队副本，想要游玩就必须进行四人组队才可以，每一次进入都会出现忍者选择页面，它每一期所能够选择的忍者列表都是不同的。有一些忍者就比较适合打忍界联军，就比如说希，他的技能能够持续进行远程伤害，不仅能打输出还可以增伤，大招自带无敌帧可以保留在最后等boss放大时规避伤害。并且该玩法是允许玩家忍者重复的，所以最好是和组队的人商量明白是速通还是正常打，如果是速通十有八九会选择该期的强势忍者来打速推，正常打就可以掏出自己擅长的角色。
该玩法一共有三个阶段，还有一个隐藏关卡可以进入。第一个阶段比较好打，敌方单位就是大量的白绝，并没有什么难度但要打比较高的连击才能有不错的分数，并且因为有时间限制，所以打够150连击获得不错的评价就好。第二阶段打忍刀七人众，可以由四个人分配来打，如果一个个进行群殴打击的话就会导致进度过慢，可能卡在最后一关时间不够用。逐个进行突破，出现某个比较难打的敌人就等待所有人群殴，提前最好做好商量，听从安排谁打谁。
第三阶段是最难的部分，相当于正常通关的boss。进去之后先集火打阿斯玛，将其的封印值降下去之后就可以打金角银角，两个敌人有不同的针对打法，打金角要注意拾盾，打银角则要看准时间砍掉属性球破防，因为存在协同机制，所以要控制好血量争取一同进行击杀。若是出现进度不同，就让打得快的那边分散一人前往另一边进行火力补给或是再打一次阿斯玛，打断复活机制。只要将前三关的时间控制在十分钟之内，就可以进入隐藏关打尾兽化的金角，这里打法就直接集火就好。
