丹药是用来辅助战斗使用的道具，能给队伍带来加成或者恢复效果。对战斗有关的丹药有会心丹，可以在战斗中使用，使用后自己的下一次攻击一定会触发暴击，对输出高的角色来说可以打出更高的伤害。会心丹只能是携带者自己使用，不能给其他人使用。另外还有会心石，效果是一样的，不过在使用后会在损坏和不会损坏之间随机触发一个效果，如果没有损坏就可以一直使用下去。还有智复丹，是用来恢复智力点用的，军师在使用计策时会消耗智力点，用来给谋略性质的武将补充用的。
还有对兵力也就是生命值恢复的丹药，赤仙丹可以恢复一个武将100点的兵力，在游戏初期兵力较少时可以使用，这个丹药的进阶版本是铜仙丹，一次可以恢复500点的兵力，这个恢复能力可以用到游戏的中后期，对于兵力少的角色来说可以一直用下去。更进一步的是银仙丹，一次能恢复1000点的生命，在后期大部分都是使用这个丹药，还有最顶尖的金仙丹，一个可以恢复4500的生命，基本上能将一个角色的生命回满。
恢复类丹药是在战斗中使用最多的一类，还有特殊丹药招魂丹，可以将已经阵亡的武将在战斗中复活并有400点的兵力，是避免减少人员伤亡的必备丹药。九转丹是剧情内出现的丹药，只用于在剧情中解谜使用。比较珍贵的有太上金丹，会提升一个武将的属性，需要谨慎分配。
