小队突袭是游戏中的一个匹配玩法模式，需要2到3组的人才能挑战，在通关之后可以获得秘卷的碎片和轮回石，秘卷碎片集齐之后可以合成完整的秘卷，轮回石在洗练神器时有重大的作用。在小队突袭界面消耗一定的铜币就能开始匹配了，该模式一共有普通和困难两个难度，如果想获得更多的通关奖励可以将左下角的奖励翻倍打开，不过需要消耗50个金币。在匹配时一场战斗中不能出现两个一模一样的忍者，在确定各自的忍者后就能进去了。
进入之后会出现四波的战斗，一些小怪和两个boss，boss的类型是随机出现的。第一波的时候就是小怪很容易就能解决，第二波会出现一个boss带着小怪，第三波也是一样，最后一波是两个boss一起出来。玩家需要操作自己的忍者对他们进行攻击，这需要玩家之间有配合的意识，不然会遇到我把怪打飞你却正好放技能空掉的情况。最好就是两个玩家将怪物聚集在一起，另外一个玩家趁此机会输出。
在战斗时不要各自为战，boss的攻击伤害还是挺高的，加上有小怪的骚扰，不注意自己就会被攻击命中。小队突袭中还有一个组织突袭，这是和自己同一个组织的才能加入队伍，和组织内部的配合要比和陌生人好一些。不管什么模式困难模式的奖励要高出2倍，但是需要的战斗力也要更高，难度也会成倍的提高。
