妙法塔内共有13层需要探索，里面包括多场战斗和迷宫层，而且还有通关时间限制。因此玩家需要在每层选择正确的路线，当舍利亮起的提示出现说明所选的路线是正确的。另外战斗时间也包含在通关时间里，玩家需要在每场战斗里速战速决，最后一场BOSS战要留够时间。为了降低妙法塔的通关难度，在进入前需要做些准备，比如带入一些祝福效果。在探索妙法塔之前要先去把通南北探索完，这个区域得到的祝福是可以带进妙法塔的。
然后是国子监这个建筑，探索完也能得到一个祝福，还能得到一个护身符增加妙法塔的通关时间。进入妙法塔的一层要小心前进，然后可以从给出的好几个迷之物里选择两个，它们都有不同的增益效果。这里按照自己的队伍阵容去选就行，比如增加回复效果或者缩短技能冷却的。第二三五七层就是迷宫层了，这里有好几个选择，每个选择对应不同的敌人和不同点数的光。
这些迷宫层数得到的光可以用来修补舍利，每次修补要花30点光，可以让自己身上的一个诅咒效果消失。第四层有一场战斗，玩家尽量要在十秒内打完，进入六层后会得到一个流血不止的诅咒效果。第八层熄灭烛火后得到一个无尽黑暗的诅咒，到了第九层可以修补舍利把前面得到的诅咒清除。第10和11层都是战斗关，打完后可以在12层短暂休息补充状态，然后去最后一层里打妙法塔的BOSS。
