在火红这个版本中的圣兽指的是拥有雷、水、火三种自然力量的宝可梦，被玩家称为雷公、水君和炎帝，他们是凤王底下的使者，用于观察人类的活动。在一周目的时候无法遇到，玩家通关一周目后，也就是击败四大天王之后三个圣兽会解封出来，这时候在关都地区的任何地方都有机会遇见它们。如果你在初始游戏开始时选择的是小火龙，那么你就会遇见水君，选择的是妙蛙种子，则会遇见炎帝，杰尼龟则可见到雷公，好像是与你初始选择的宝可梦的属性相反。三只圣兽的等级固定为50级，每次加载地图后出现的位置为变化，所以非常看玩家的运气。
比较高效的捕捉方式是去圆珠市的37号道路的下方草丛力，在遇到第一只野生的宝可梦时对其使用除虫喷雾，随后在草丛中反复遇怪，有较大的概率可以遇到圣兽，圣兽出现时bgm会发生变化。
为了防止遇到之后圣兽会逃跑，可以携带一只鬼斯通，先使用黑色目光技能防止跑掉，用你的主c宝可梦进行攻击，但是不要打死，打死就要重新开始了，将圣兽的血量降至变红为止，血量越低收服的概率越高。这时使用精灵球可以进行收服了，为了保险可以花钱买一些品质高的精灵球，普通精灵球会瞬间挣破的。在成功捕捉后立刻保存，让偶重启游戏，按照上面的方面继续，直到三只圣兽收入囊中。
