在地牢的深处可以找到六个神秘的特殊宝箱，这六个特殊宝箱分别对应着四大职业。其中有封印着沙漠虎法杖的沙漠宝箱，封印者吸血鬼刀的猩红宝箱，以及封印者食人鱼枪的丛林宝箱等。开启这些特殊宝箱的钥匙需要在对应的生态环境中，将出没在该环境中的小怪杀掉之后，就极低的基础概率会直接掉落开掉这些特殊宝箱的生态钥匙。这里需要注意每一种生态宝箱在被发现之火，从这些特殊箱子的上面就可以观察到封印诅咒。只有首次将世纪之花杀掉之后，就可以将各类生态宝箱上面的封印给解掉。
紧接着就可以携带从对应生态环境中收获到的生态钥匙，依次将地牢深处的这些特殊箱子给开掉。此外在每一个世界中至多会直接生成五个不同的特殊生态宝箱，如果你所在的当前世界为邪恶为猩红的话，那么在地牢的深处就可以连续收获到五个猩红宝箱。
除了在地牢深处可以找到这些特殊生态宝箱外，还可以在各个地牢房间中收获到金色的箱子。这些金色箱子需要使用对应的黄金钥匙才能开掉，通过击杀掉地牢中的骷髅王就有机会将黄金钥匙拿到手。所以在前往地牢中探索这些宝箱之前一定要提前备好宝箱钥匙，因为在重新进入到地牢的深处之后，这些特殊箱子的位置有一定的几率会刷新在其他的点位上，而持有钥匙时就可以将其直接开掉。
